フトアゴヒゲトカゲは成長すると全長40cm〜50cmほどになります。そのため、成体には最低でも幅90cm、奥行き45cm以上のケージが必要です。幼体の頃は小さなケージでも管理しやすいですが、成長スピードが速いため、最初から大型ケージを用意しておくのも一つの手です。
ケージの材質には、保温性に優れた木製や、手入れがしやすく観察もしやすいガラス製、通気性の良いメッシュタイプなどがあります。日本の住宅環境や季節に合わせ、温度と湿度を一定に保ちやすいものを選びましょう。また、彼らは立体的な活動も好むため、流木や岩を配置して運動スペースを広げてあげることが大切です。
変温動物であるフトアゴにとって、日光浴（バスキング）は消化を助け、活動の源となる熱を得るための非常に重要な行為です。ケージ内にはバスキングライトを設置し、局所的に40℃前後の「ホットスポット」を作ります。
重要なのは、ケージ内に温度差（温度勾配）を作ることです。ホットスポットの反対側は25℃〜28℃程度のクールスポットとして確保し、トカゲが自分の体調に合わせて好きな温度の場所を移動できるように設計します。夜間はライトを消し、20℃を下回らない程度に保温器具で調整しましょう。
フトアゴヒゲトカゲは野生下で強い日光を浴びて生活しています。飼育下では、太陽光の代わりにUVB（紫外線B波）を照射するライトが不可欠です。UVBを浴びることで体内にビタミンD3を生成し、食事から摂取したカルシウムを吸収できるようになります。
UVBが不足すると、骨が軟化したり変形したりする「くる病」などの重篤な疾患を招く恐れがあります。紫外線ライトは見た目が明るくても、時間の経過とともに紫外線量が低下するため、半年から1年を目安に定期的な交換を行いましょう。
フトアゴヒゲトカゲは雑食性ですが、成長段階によって必要な栄養バランスが大きく変わります。ベビーからヤング期は、体を作るためにタンパク質を多く必要とするため、コオロギやデュビアなどの生餌をメインに与えます。この時期は毎日食べるだけ与えるのが基本です。
成体（アダルト）になるにつれて徐々に植物食性が強まります。成体の理想的な食事バランスは「野菜7：虫3」程度と言われており、小松菜、チンゲン菜、豆苗、カボチャなどの野菜を主食にシフトさせます。成体になっても虫ばかり与え続けると、肥満や内臓疾患の原因になるため注意が必要です。
毎日の排泄物の掃除は清潔な環境を保つために必須です。また、新鮮な飲み水を用意することも忘れてはいけません。水入れから水を飲むのが苦手な個体には、霧吹きで野菜を濡らしたり、週に1〜2回の温浴（35℃前後のぬるま湯）をさせることで水分補給と排便を促すことができます。
日常の観察では、目が生き生きとしているか、脱皮不全が起きていないか、四肢の動きに違和感はないかなどをチェックしましょう。特にお腹を地面にべったりつけたままで動かない場合は、温度不足や体調不良のサインかもしれません。日頃のコミュニケーションを通じて、彼らの健康状態を把握しておくことが長寿の秘訣です。
基本的に単独飼育が推奨されます。特にオス同士は縄張り意識が強く激しく争います。メス同士やペアでも、相性によっては噛み合いやストレスによる成長阻害が起きるため、1つのケージに1匹で飼育するのが最も安全です。
適切な飼育環境下では、平均して10年から15年ほど生きます。中には15年を超える長寿な個体も報告されており、一生を通じた責任ある飼育計画が求められます。
フトアゴは動くものに興味を示すため、野菜をピンセットで揺らしたり、生餌を野菜の中に混ぜて一緒に食べさせたりするのが有効です。また、好みの野菜（色の濃い葉物やカボチャなど）を探してバリエーションを増やすことも試してみましょう。